Araştırmacılar, hücrelerdeki spesifik proteinleri tespit etmek için yeni ve daha verimli genetik muhabir proteinleri yarattılar, genetik malzeme ve hücre içi işlemlerin çalışmasında yardımcı olduğuna inanılan bir adım, mühendislik veya başka şekilde. Genetik olarak kodlanmış muhabir proteinleri, biyoteknoloji alanlarında çok fazla kullanımdır. Bu muhabir proteinleri bazı proteinleri tespit etmeye yardımcı olur ve tasarlanmış genetik devreleri çözer. Bununla birlikte, geleneksel muhabir proteinleri protein moleküllerinin floresansına dayanır, bu da bazı suşları tespit etmeyi zorlaştırır. Bununla birlikte, Washington Üniversitesi'ndeki araştırmacılar ve Microsoft, 'Nanopore algılama cihazı' tarafından okunabilen raportör proteinleri geliştirmiştir.
Araştırmacılar, bu yeni raportör proteininin nanopore-adreslenebilir protein etiketlerini gazeteciler olarak tasarlanmış (nanoporeterler veya). Ekip 20 bu tür etiketi geliştirdi ve onları bir kütüphanede sakladı.
Araştırma raporu, doğa biyoteknolojisinde yayınlandı. Muhabir proteinleri, araştırmacıların hücre işlemleri ve anomalileri hakkında veri toplamalarına yardımcı olabilir. Geleneksel olarak, sadece floresan etkileri gösteren optik proteinler deneme ve hata yöntemi ile tespit edilebilir. Aynı anda incelenebilecek maksimum protein iplikçik sayısı da sınırlıydı. Bu büyük ölçüde hücresel düzeyde araştırma sınırlıdır.
Bununla birlikte, yeni sentetik proteinler hücresel çevre hakkında bilgi toplamak için bir hücrenin dışında salgılanır. Nanopore dedektörüne cevap veren farklı amino asit "barkodları" taşırlar. Çalışma için araştırmacılar Oxford Nanopore Technologies Minion Cihazını kullandı. Bu muhabir proteinleri ile aynı anda en az 10 kat daha fazla çoğullama olanak sağlayan daha fazla protein iplikçiklerini okumak da mümkündür.
Nters, bir elektrik alanı aracılığıyla bir nanopore sensörlerine çeken "kuyrukları" olan proteinlerdir. Ardından araştırmacılar, bu elektriksel sinyalleri çözmeyi ve bunları NTER barkodlarına göre sınıflandırmayı makine öğrenmesini kullanın.
"Bu, hücrelerle bilgisayarlar arasındaki temel olarak yeni bir arayüzdür", "Eurekalert, Dokuz yazardan biri olan Jeff Nivala, Washington Araştırma Yardımcısı Profesörü olan Jeff Nivala'nın bir raporunu söylüyor.
Kurşun ortak yazarı Karen Zhang, bu inçleri 20 etiketin ötesinde genişletme potansiyelini gördü. Aynı raporda "Şu anda nanoporeter sayısını yüzlerce, binlerce, belki milyonlarca daha fazla ölçeklendirmek için çalışıyoruz" dedi.
NTERS, hastalıkları tespit ettiğimiz veya terapötikleri vücuttaki belirli alanlara kadar değiştirme şeklini değiştirebilir. Ve "karmaşık genetik devre tasarımlarını hata ayıklama", bu araştırmadan faydalanacak başka bir alandır.
Kaynak: Gadgets 360